Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHLHE41Q9C0J9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms