Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTMR12Q9C0I1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms