Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPEF2Q9C093 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPEF2Q9C093 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms