Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP1Q9C000 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms