Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms