Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA7Q9BWT1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA7Q9BWT1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms