Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GORASP1Q9BQQ3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GORASP1Q9BQQ3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms