Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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