Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms