Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAJA3Q96EY1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms