Protein–RNA interactions for Protein: Q92841

DDX17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17Q92841 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX17Q92841 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX17Q92841 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms