Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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PTPRUQ92729 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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PTPRUQ92729 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRUQ92729 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRUQ92729 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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