Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms