Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELBQ8NG08 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms