Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NGDNQ8NEJ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGDNQ8NEJ9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms