Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PNLDC1Q8NA58 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms