Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZRN4Q6ZMN7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms