Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA5Q6Q788 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms