Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RCSD1Q6JBY9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RCSD1Q6JBY9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RCSD1Q6JBY9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCSD1Q6JBY9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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