Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C9orf84Q5VXU9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms