Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF3Q5VWG9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms