Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF38BQ5VTL8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF38BQ5VTL8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms