Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIF1Q5UIP0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms