Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN4Q5BKX8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms