Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF2Q5BJF6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms