Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAN3Q58A45 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms