Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms