Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRY2Q49AN0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms