Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF3Q3KNV8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF3Q3KNV8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms