Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms