Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q1T7F1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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