Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL24A1Q17RW2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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