Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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