Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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