Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITSN1Q15811 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms