Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EEA1Q15075 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EEA1Q15075 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms