Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCARF1Q14162 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARF1Q14162 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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