Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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