Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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