Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2H2Q13888 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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