Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF3Q13114 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF3Q13114 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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