Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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BNIP1Q12981 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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BNIP1Q12981 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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BNIP1Q12981 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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BNIP1Q12981 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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BNIP1Q12981 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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BNIP1Q12981 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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BNIP1Q12981 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNIP1Q12981 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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