Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms