Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms