Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms