Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPCQ01831 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPCQ01831 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
XPCQ01831 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
XPCQ01831 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPCQ01831 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPCQ01831 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms