Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2BQ00403 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms