Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP7P55210 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP7P55210 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP7P55210 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms