Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms