Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GCLMP48507 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCLMP48507 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCLMP48507 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCLMP48507 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms